Průběh zálohování dat je individuální, v závislosti na velikosti dat, jejich typu a frekvenci používání. Pro zálohování dat aplikačních serverů a důležitých pracovních stanic (např. v laboratořích) je v infrastruktuře MU poskytována služba zálohování systémem Bacula. V případě potřeby zálohování dat významných objemů či jejich dlouhodobou archivaci pak doporučujeme využití služeb hierarchických datových úložišť infrastruktury CESNET (ve speciálních případech i uložišť MU).